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时频量子态的表征需要可靠重建其时频分布。然而，不完美的传输或测量通道可能会扭曲重建的联合光谱强度，特别是在底层扰动机制未知的情况下。该工作实验性地展示了一个重建与校正框架，该框架利用时频网格态作为内在频域参考。通过分析网格点的位移，采用高斯过程回归模型来重建非线性坐标变形的校正映射，而无需假设畸变的先验物理模型。所学习的映射将时频网格态的残余坐标偏差降低了约11倍，当应用于独立的频率纠缠测试态时，高斯形状保真度从76.2%提升至90.0%。这些结果确立了时频网格态作为诊断和校正时频量子系统中畸变的实用计量资源，为抗畸变量子通信和高维量子信息处理提供了一条路径。