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本文提出了一种普适的能量本征值方程，并证明对于任何非孤立子系统都存在唯一的本征函数集或优选基。通过将新本征值方程应用于氢原子相对运动，结合推导的相对论哈密顿量来量化质子有限质量对精细结构的影响，研究获得了由相对运动与质心运动纠缠导致的精细结构修正，该结果可用于验证所提本征值方程的正确性。将该方程应用于电子双缝干涉测量时，分析表明：具有洛伦兹线型的光子波包、子系统的定义域与态密度、以及入射电子能量共同决定了电子的自发发射速率。此过程中产生的光子将探测器价带电子激发至导带。研究发现，通过最大化跃迁速率可唯一确定与任意发射或吸收光子相对应的子系统，这一新原理对原子体系同样适用。研究获得了跃迁速率的闭合表达式，数值算例显示计算结果与位置测量实验具有良好相关性。所揭示的确定子系统、优选基和跃迁速率的共同机制，为构建全新、普适且自洽的量子测量理论奠定了基础。