量子退火技术用于拓扑关联染色质域中间态的形成
拓扑关联染色质域(Topologically Associating Chromatic Domains)是通过分隔活跃与非活跃基因组元件来调控转录的空间独立染色质区域。实证研究表明,其形成与局部表观遗传标记模式相关,但连接一维表观遗传景观与三维染色质折叠的确切机制仍不明确。近期模型将染色质表述为自旋系统,其中核小体被视为离散态变量,其耦合强度源自基因组与表观基因组数据。由于高度受挫态和密集耦合,传统采样方法难以处理此类模型。该研究团队提出一种量子退火(QA)方法,将表观遗传伊辛模型嵌入D-Wave量子处理器的拓扑结构中,从而实现对染色质状态的高效采样。
